Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms