Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TPD52L3Q96J77 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms