Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTV1Q96GA3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms