Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms