Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 312.6 ms