Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRAMD1AQ96CP6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms