Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPTQ96BT3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPTQ96BT3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPTQ96BT3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPTQ96BT3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPTQ96BT3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms