Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF428Q96B54 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF428Q96B54 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms