Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC74AQ96AQ1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
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