Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RFT1Q96AA3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms