Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35C1Q96A29 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms