Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms