Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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