Protein–RNA interactions for Protein: Q969H4

CNKSR1, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 1, humanhuman

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR1Q969H4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNKSR1Q969H4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNKSR1Q969H4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
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