Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms