Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BHMTQ93088 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMTQ93088 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms