Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2A3Q93084 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A3Q93084 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms