Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCC1Q92922 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms