Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms