Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX38Q92620 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DHX38Q92620 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX38Q92620 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX38Q92620 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms