Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALLDQ8WX93 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms