Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms