Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC40.93■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC40.82■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
RB1CC1Q8TDY2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.81■■■■■ 4.12
RB1CC1Q8TDY2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms