Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF3IP1Q8TDR0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAF3IP1Q8TDR0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAF3IP1Q8TDR0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF3IP1Q8TDR0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF3IP1Q8TDR0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF3IP1Q8TDR0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF3IP1Q8TDR0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF3IP1Q8TDR0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF3IP1Q8TDR0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF3IP1Q8TDR0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF3IP1Q8TDR0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF3IP1Q8TDR0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF3IP1Q8TDR0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF3IP1Q8TDR0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF3IP1Q8TDR0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF3IP1Q8TDR0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF3IP1Q8TDR0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms