Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HELQQ8TDG4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELQQ8TDG4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms