Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.4 ms