Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC148Q8NFR7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC148Q8NFR7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms