Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE23Q8NDY6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms