Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PNLDC1Q8NA58 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms