Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
AMER3Q8N944 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
AMER3Q8N944 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
AMER3Q8N944 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms