Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSL3Q8N5Y2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MSL3Q8N5Y2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MSL3Q8N5Y2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSL3Q8N5Y2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSL3Q8N5Y2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms