Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3E9

PLCD3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCD3Q8N3E9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLCD3Q8N3E9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms