Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms