Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACE1Q8IYU2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACE1Q8IYU2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms