Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP2LQ8IYA6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP2LQ8IYA6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP2LQ8IYA6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP2LQ8IYA6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP2LQ8IYA6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP2LQ8IYA6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2LQ8IYA6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKAP2LQ8IYA6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms