Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMNTD2Q8IXW0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms