Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KSR1Q8IVT5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms