Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM50Q86XT4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms