Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms