Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms