Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CACNA2D4Q7Z3S7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D4Q7Z3S7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms