Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST3Q7LGC8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST3Q7LGC8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms