Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms