Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00173Q6ZV60 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms