Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX8Q6ZV50 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
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