Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC149Q6ZUS6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms