Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCIMPQ6UWF3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms