Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMOD2Q6P5Q4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms