Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFXN4Q6P4A7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms