Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6P435 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6P435 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6P435 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6P435 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q6P435 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6P435 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6P435 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6P435 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6P435 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6P435 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6P435 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6P435 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6P435 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6P435 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6P435 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6P435 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6P435 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6P435 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6P435 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6P435 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6P435 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6P435 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6P435 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q6P435 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6P435 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6P435 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6P435 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6P435 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6P435 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6P435 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6P435 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6P435 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6P435 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6P435 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6P435 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6P435 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6P435 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6P435 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6P435 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6P435 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6P435 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6P435 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q6P435 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q6P435 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q6P435 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q6P435 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q6P435 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q6P435 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q6P435 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q6P435 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6P435 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6P435 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6P435 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6P435 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6P435 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6P435 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6P435 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q6P435 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6P435 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6P435 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6P435 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6P435 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6P435 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6P435 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6P435 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6P435 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6P435 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6P435 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6P435 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6P435 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6P435 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6P435 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6P435 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q6P435 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6P435 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6P435 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6P435 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6P435 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6P435 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6P435 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6P435 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6P435 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6P435 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6P435 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6P435 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6P435 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6P435 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6P435 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6P435 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q6P435 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6P435 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6P435 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6P435 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6P435 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6P435 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6P435 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6P435 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6P435 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q6P435 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms